1 資金投入不足，管理不夠完善

我國生物技術制藥行業存在的問題分析我國科研經費屬于劃撥制，各個科研機構，大專院校，政府研發部門處于完全競爭條件之下，經費需求異常激烈，投入資金不足的狀況經常出現。從而出現申請項目浪費的精力過多，嚴重影響科技研究的進展，和研究成果的質量。

2 缺乏創新產品，重復研究開發

近30幾年發展以來,我國生物技術產業的研究和開發能力嚴重不足,進展緩慢，成果稀少。且大多數產品還停留在單純模仿仿制國外已經上市產品品種上，或直接引進過來，真正稱得上具有我國自主知識產權的產品較少。我國生物技術領域近幾十年來，缺乏系統性，科學性，有效性的科研路線。大部分機構研發人員，科研人員，在技術不成熟條件下，盲目試驗開發，急于求成，缺乏戰略性的規劃。

3 資源裝備落后，成果轉化率低

我國目前用于生物技術研究開發，及產業發展所用的儀器、設備等基礎設施，技術裝備十分落后，大多依賴國外進口，尚不具備自主研發的能力，配套的能力。

我國生物技術制藥行業存在的問題分析，致使產業化能力薄弱,企業規模較小,生產條件差，資金不到位等問題出現。由于生物技術包括跨學科，多元化的特點，其成果轉化具有特殊和復雜性。